Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGNL1Q0VF96 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms