Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms