Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms