Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms