Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms