Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms