Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms