Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms