Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms