Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms