Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2FP61218 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms