Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms