Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms