Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPAP53621 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPAP53621 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPAP53621 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPAP53621 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPAP53621 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms