Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms