Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms