Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NESP48681 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NESP48681 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NESP48681 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NESP48681 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NESP48681 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NESP48681 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms