Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms