Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT5P48643 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms