Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms