Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms