Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP12P39900 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP12P39900 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms