Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms