Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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