Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCAP28676 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms