Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms