Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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