Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms