Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms