Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms