Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI3P10071 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms