Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms