Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms