Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms