Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms