Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms