Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms