Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms