Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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