Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms