Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.5 ms