Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP164Q9UPV0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms