Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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