Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLH3Q9UHC1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms