Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDH10Q9P2E7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms