Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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