Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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