Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms