Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms