Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms